Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms