Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPOP42166 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPOP42166 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPOP42166 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms