Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCAP28676 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 DEFA8P-201ENST00000457582 285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCAP28676 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCAP28676 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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