Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ACTG1P10-201ENST00000428275 1082 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SIGLEC21P-201ENST00000598990 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RPSAP19-201ENST00000431241 880 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LINC02395-202ENST00000547443 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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