Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CHI3L2-201ENST00000369744 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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