Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms