Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDC27P30260 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC27P30260 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms