Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms