Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC133548.2-202ENST00000562267 148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC118553.1-201ENST00000454219 655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 IFNWP19-201ENST00000438727 566 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC087463.4-201ENST00000561964 448 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms