Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC093367.1-201ENST00000517332 420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC025278.3-201ENST00000636139 796 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC005682.1-201ENST00000452069 1467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms