Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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