Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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