Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SCG3Q8WXD2 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SCG3Q8WXD2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SCG3Q8WXD2 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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