Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL118557.1-201ENST00000554408 440 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC021683.4-201ENST00000623348 1099 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms