Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms