Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD2APQ9Y5K6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD2APQ9Y5K6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD2APQ9Y5K6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms