Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUPT16HQ9Y5B9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUPT16HQ9Y5B9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms