Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms