Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LAMP3Q9UQV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMP3Q9UQV4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms