Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVW-1Q9UQF0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms