Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM35Q9UPQ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM35Q9UPQ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms