Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRQQ9UMZ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRQQ9UMZ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms