Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF19Q9UMS4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF19Q9UMS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms