Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO4Q9UKT5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO4Q9UKT5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms