Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERG28Q9UKR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERG28Q9UKR5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms