Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PILRAQ9UKJ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms