Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FBXO3Q9UK99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO3Q9UK99 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO3Q9UK99 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO3Q9UK99 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO3Q9UK99 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms