Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH22Q9UJ99 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms