Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP2Q9UHC6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms