Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP2Q9UDT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms