Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP28Q9P2N2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP28Q9P2N2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms