Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1BQ9P298 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1BQ9P298 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms