Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP5Q9NZZ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHMP5Q9NZZ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms