Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L2Q9NZM6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms