Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY12

GAR1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAR1Q9NY12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAR1Q9NY12 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAR1Q9NY12 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms