Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms