Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUA8

ZBTB40, Zinc finger and BTB domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB40Q9NUA8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBTB40Q9NUA8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB40Q9NUA8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms