Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF4Q9NR80 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF4Q9NR80 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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