Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAR1AQ9NR31 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAR1AQ9NR31 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms