Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1BQ9NQG5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRD1BQ9NQG5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms