Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms