Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms