Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUFT1Q9NNX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUFT1Q9NNX1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms