Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XAB2Q9HCS7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
XAB2Q9HCS7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XAB2Q9HCS7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms