Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms