Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A3Q9HC58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms