Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH9Q9HC56 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms