Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC4Q9HBW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC4Q9HBW1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms