Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms