Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STN1Q9H668 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms